Как самостоятельная нозология фарингит у детей развивается при непосредственном воздействии инфекционных возбудителей на слизистую глотки. Кроме этого, острый фарингит может служить одним из проявлений воспалительных заболеваний верхних дыхательных путей, общих инфекций, кишечных инфекций и т. д.
Наибольшая роль в этиологии фарингита у детей принадлежит вирусной инфекции (вирусам гриппа и герпеса , аденовирусам, энтеровирусам ) и бактериальным микроорганизмам (гемофильной палочке, моракселлам, стрептококкам групп А, С, G, диплококкам, коринебактериям дифтерии), грибкам, внутриклеточным агентам ( микоплазме , хламидиям ). Острые фарингиты вирусной этиологии у детей составляют 70% случаев, бактериальные и остальные - 30%.